MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 164482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002678	CGT	2	6	171684	171689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470514
4002	NC_002678	CG	4	8	171749	171756	0 %	0 %	50 %	50 %	13470514
4003	NC_002678	AGC	2	6	171773	171778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470514
4004	NC_002678	TCT	2	6	171845	171850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470514
4005	NC_002678	TGC	2	6	171875	171880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470514
4006	NC_002678	GTG	2	6	171983	171988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470514
4007	NC_002678	GACC	2	8	172002	172009	25 %	0 %	25 %	50 %	13470514
4008	NC_002678	TCG	2	6	172058	172063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470514
4009	NC_002678	CAG	2	6	172066	172071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470514
4010	NC_002678	GGC	2	6	172176	172181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_002678	GCC	2	6	172189	172194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_002678	GCC	2	6	172303	172308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470515
4013	NC_002678	GTG	2	6	172463	172468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470515
4014	NC_002678	GGC	2	6	172475	172480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470515
4015	NC_002678	GCC	2	6	172489	172494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470515
4016	NC_002678	TGT	2	6	172506	172511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13470515
4017	NC_002678	GTG	2	6	172520	172525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470515
4018	NC_002678	CAT	2	6	172528	172533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470515
4019	NC_002678	GGC	2	6	172540	172545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470515
4020	NC_002678	CGC	2	6	172552	172557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470515
4021	NC_002678	GCC	3	9	172595	172603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470515
4022	NC_002678	GC	3	6	172731	172736	0 %	0 %	50 %	50 %	13470516
4023	NC_002678	GC	3	6	172771	172776	0 %	0 %	50 %	50 %	13470516
4024	NC_002678	GCT	2	6	172825	172830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470516
4025	NC_002678	TCA	2	6	172920	172925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470516
4026	NC_002678	CCGCCA	2	12	172927	172938	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	13470516
4027	NC_002678	CCG	2	6	172960	172965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470516
4028	NC_002678	ACC	2	6	173016	173021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470516
4029	NC_002678	TGC	2	6	173034	173039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470516
4030	NC_002678	TGT	2	6	173097	173102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13470516
4031	NC_002678	TAG	2	6	173106	173111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470516
4032	NC_002678	GAC	3	9	173126	173134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470516
4033	NC_002678	CGA	2	6	173197	173202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470516
4034	NC_002678	ACG	2	6	173205	173210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470516
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4036	NC_002678	CCG	2	6	173260	173265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470516
4037	NC_002678	CG	3	6	173290	173295	0 %	0 %	50 %	50 %	13470516
4038	NC_002678	CAA	2	6	173368	173373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470516
4039	NC_002678	GGC	2	6	173534	173539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470517
4040	NC_002678	TGG	2	6	173593	173598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470517
4041	NC_002678	AAAGC	2	10	173660	173669	60 %	0 %	20 %	20 %	13470517
4042	NC_002678	CTA	2	6	173690	173695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470517
4043	NC_002678	TGA	2	6	173747	173752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470517
4044	NC_002678	CGG	2	6	173791	173796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470517
4045	NC_002678	AGC	2	6	173844	173849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470517
4046	NC_002678	CGA	2	6	173903	173908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470517
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4050	NC_002678	GGC	2	6	174256	174261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470517
4051	NC_002678	CTG	2	6	174309	174314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470517
4052	NC_002678	TGG	3	9	174364	174372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470517
4053	NC_002678	CGGA	2	8	174608	174615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_002678	CCG	2	6	174622	174627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_002678	GCT	2	6	174647	174652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_002678	CGG	2	6	174736	174741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470518
4057	NC_002678	CGC	2	6	174749	174754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470518
4058	NC_002678	CCA	2	6	174774	174779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470518
4059	NC_002678	TCA	2	6	174845	174850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470518
4060	NC_002678	TCG	2	6	174860	174865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470518
4061	NC_002678	TGC	2	6	174878	174883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470518
4062	NC_002678	TCA	2	6	174893	174898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470518
4063	NC_002678	AAG	2	6	174907	174912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470518
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4065	NC_002678	GGGAT	2	10	174988	174997	20 %	20 %	60 %	0 %	13470518
4066	NC_002678	GCA	2	6	175008	175013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470518
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4068	NC_002678	ACT	2	6	175072	175077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_002678	CCT	2	6	175109	175114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_002678	AGG	2	6	175188	175193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470519
4071	NC_002678	TCA	2	6	175194	175199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470519
4072	NC_002678	TCG	2	6	175239	175244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470519
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4074	NC_002678	GTC	2	6	175273	175278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470519
4075	NC_002678	GCAT	2	8	175290	175297	25 %	25 %	25 %	25 %	13470519
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4083	NC_002678	ATC	2	6	175388	175393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470519
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4089	NC_002678	TGC	2	6	175518	175523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470519
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4092	NC_002678	CCA	2	6	175622	175627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470519
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4103	NC_002678	GAG	2	6	175894	175899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_002678	CAA	2	6	175906	175911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_002678	GCTGC	2	10	176001	176010	0 %	20 %	40 %	40 %	13470520
4106	NC_002678	CGA	2	6	176020	176025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470520
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4108	NC_002678	GCC	2	6	176123	176128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470520
4109	NC_002678	TGA	2	6	176257	176262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470520
4110	NC_002678	CCT	2	6	176266	176271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470520
4111	NC_002678	CGAGCG	2	12	176272	176283	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13470520
4112	NC_002678	AGCGA	2	10	176346	176355	40 %	0 %	40 %	20 %	13470520
4113	NC_002678	GCAT	2	8	176396	176403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4114	NC_002678	AG	3	6	176419	176424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_002678	GCC	2	6	176431	176436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4116	NC_002678	TTC	2	6	176473	176478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_002678	GC	3	6	176495	176500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4118	NC_002678	GC	3	6	176529	176534	0 %	0 %	50 %	50 %	13470521
4119	NC_002678	ATC	2	6	176540	176545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470521
4120	NC_002678	CGC	2	6	176637	176642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470521
4121	NC_002678	GGC	2	6	176671	176676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470521
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4123	NC_002678	TCG	2	6	176711	176716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470521
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4250	NC_002678	GCC	2	6	182945	182950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470526
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4366	NC_002678	GAC	2	6	187967	187972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470533
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4369	NC_002678	GGA	2	6	188178	188183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4370	NC_002678	ATC	2	6	188323	188328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470534
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4372	NC_002678	CAT	2	6	188418	188423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470534
4373	NC_002678	GAA	2	6	188442	188447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470534
4374	NC_002678	GCC	2	6	188452	188457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470534
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4377	NC_002678	CTGGGG	2	12	188621	188632	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	13470534
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4392	NC_002678	CTG	2	6	189396	189401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4481	NC_002678	CCG	2	6	193356	193361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4489	NC_002678	GCCGC	2	10	193725	193734	0 %	0 %	40 %	60 %	13470542
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4492	NC_002678	TCG	2	6	193950	193955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470542
4493	NC_002678	CG	4	8	193973	193980	0 %	0 %	50 %	50 %	13470542
4494	NC_002678	CGT	2	6	194030	194035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470542
4495	NC_002678	CCG	3	9	194051	194059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470542
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4497	NC_002678	ACA	2	6	194128	194133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470542
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4499	NC_002678	AAG	2	6	194259	194264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470542
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